Nummerierung geändert

find_URLs.R

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-library("stringr")
-library("readxl")
-library("writexl")
-
-#Konfiguration einbinden
-source("config/config.R")
-
-## nicht meine Funktion - eingebunden von https://rdrr.io/cran/retractcheck/src/R/utils.R
-find_doi <- function (strings) {
-  regex <- '10\\.\\d{4,9}/[-._;()/:A-Z0-9]+'
-  doiLoc <- gregexpr(text = strings, pattern = regex, perl = TRUE, ignore.case = TRUE)
-  
-  i <- 1
-  res <- NULL
-  
-  # for each in the doiLoc list check whether match (!-1)
-  for ( i in 1:length(doiLoc) ) {
-    if ( doiLoc[[i]][1] != -1 ) {
-      for ( j in 1:length(doiLoc[[i]]) ) {
-        res <- c(res,
-                 substring(strings[i], doiLoc[[i]][j], doiLoc[[i]][j] + attr(doiLoc[[i]], 'match.length')[j] - 1))
-      }
-    }
-  }
-  
-  return(res)
-}
-
-
-## nicht meine Funktion - eingebunden von https://stackoverflow.com/questions/52911812/check-if-url-exists-in-r
-valid_url <- function(url_in,t=2){
-  con <- url(url_in)
-  check <- suppressWarnings(try(open.connection(con,open="rt",timeout=t),silent=T)[1])
-  suppressWarnings(try(close.connection(con),silent=T))
-  ifelse(is.null(check),TRUE,FALSE)
-}
-
-
-url_pattern <- "http[s]?://(?:[a-zA-Z]|[0-9]|[$-_@.&+]|[!*\\(\\),]|(?:%[0-9a-fA-F][0-9a-fA-F]))+"
-
-#Excel mit den Zitaten die hinzugefügt werden sollen einlesen
-df <- data.frame(read_excel(paste(PFAD_EXCEL, "distincts_automated_gc3d.xlsx", sep="")))
-df <- data.frame(lapply(df, stri_enc_toutf8))
-
-#Neue Spalte für die DownloadLinks erstellen
-df['downloadLink'] <- NA
-
-#Schleife um nach Links zu suchen
-for (element in 1:length(df$bibliographicCitation)) {
-  
-  #Extrahiert eventuell URLs oder DOI Angaben
-  url <- str_extract(df$bibliographicCitation[element], url_pattern)
-  doi <- find_doi(df$bibliographicCitation[element])
-  
-  #Es wird nur dann versucht aus der DOI-Angabe eine URL zu erstellen, falls es keine URL gibt
-  if (is.na(url) && !is.null(doi)) {
-    #Entfernt das letzte Zeichen falls es ein Punkt ist (kommt öfter vor, deshalb so spezifisch)
-    if(substring(doi, nchar(doi)) == "."){
-      doi <- substring(doi, 1, nchar(doi) - 1)
-    }
-    
-    #Generiert aus der DOI eine URL
-    url <- paste("https://doi.org/", doi, sep="")
-  }
-  
-  #Falls es eine URL gibt, wird überprüft ob diese auflösbar ist
-  if (!is.na(url) && valid_url(url)) {
-    df$downloadLink[element] <- url
-  }
-}
-
-write_xlsx(df, paste(PFAD_OUT, "distincts_automatisch_mit_URL",format(Sys.time(), "%Y_%m_%d") ,".xlsx", sep=""))